接下来袁崇焕让迫击炮调高角度，向城门洞两侧吊射，仍然是五轮炮击，等到炮击结束后，明军开始按照排队枪毙的阵形向城内进攻。卜石兔台吉听到两个城门被破，吓得够呛，立刻组织士兵们反击，于是大批的士兵都向城门洞附近压来。
计划都是安排好的，明军面对自己几倍的敌人也不慌张，大路中间是五挺手摇机枪镇守，两侧是五排高低不等的击发枪士兵，也不慌着向里攻击，就在城门洞附近大量的射杀敢于冲过来的卜石兔台吉的士兵。为了保持能够有持续的火力压制，击发枪士兵每人射出五发子弹以后立刻退下，再换一批士兵，免得枪管发热爆炸伤了自己。卜石兔台吉害怕明军冲进城里，就不断的向这里派兵，明军将计就计就在城门附近大量的杀伤，双方都按照自己的意图在这里僵持。
在进行了一天的拉锯战以后，天色渐渐的黑了下来，明军按照袁崇焕的指示撤到了城门外面，只是仍然死死的围住城门洞，就是不让任何人冲出来。到了晚上，为了防止西、南两个城门出来卜石兔台吉的人马袭击，袁崇焕就把人马全部撤回营地，毕竟卜石兔台吉有五万多人，自己只有八千人，还是小心为妙。
其实，就在白天的时候，卜石兔台吉就想从那两个方向包抄明军后路，可惜的是没有一个将领敢带队出来，等到晚上视线不好了，卜石兔台吉才组织两万人从两侧出来包抄，想乘明军射击视线不好的机会突击，但是明军已经撤回了营地，向营地攻击？还是省点劲、节省点兵力吧，那是找死。
第二天、第三天仍然是第一天的翻版，明军仍是在城门口附近大量的杀伤，就是不进入城区打巷战，弄得卜石兔台吉毫无办法。三天的攻城战，按正常的攻城战来说，攻防的死亡是守方的两倍，可是袁崇焕这种攻城的方式，却让守方的卜石兔台吉伤亡了百倍不止，明军自己反而没有什么伤亡，这就是武器和战术的优势，人多也不管事。
第四天，袁崇焕仍然像前三天那样进攻，但是发现对方的人马越来越少，一击就溃。原来经过三天的搏杀，卜石兔台吉的人马已经不足二万，士兵们已经彻底胆寒。于是，袁崇焕调整了一下战术，两个城门各留一千人，其余两千人沿着大街小巷缓慢向前推进，所过之处必须是无人区，免得敌人反扑。
反扑不会有了，卜石兔台吉已经准备逃跑了，他已经失去了雄心壮志，现在的想法是保住命再说东山再起的事吧。三天的血肉磨坊般的争夺，磨死的都是他自己的士兵。卜石兔台吉已经彻底丧失了斗志，就在明军再次进入城门洞的时候，卜石兔台吉已经带人向西、南两个城门逃跑了，所以明军受到的反击越来越弱，等到明军彻底占领西宁的时候，城里面除了明军已经没有任何活人了，除了逃跑的都让卜石兔台吉逼着堵抢眼了。
从西城门仓皇逃出的卜石兔台吉，带着手下手下不足万人，其他的早就树倒猢狲散了。出城不到十里，迎面就碰上了李鸿基、刘宗敏的人马，一阵的炮轰枪杀，卜石兔台吉的人马立刻就四散奔逃了，李鸿基、刘宗敏紧盯着卜石兔台吉的大汗旗，这家伙到现在竟然还没有想起扔掉。看看前面冲不过去，卜石兔台吉领着残兵败将就向南逃去，手下到现在连五千人都不到了。
向南逃了半晌，正在人困马乏之时，从前方飞过来一排小****，三轮过后，郝永忠一马当先就冲了过来，随他后面的是三十名亲兵，郝永忠左手持****，右手握着“雪枫刀”，直奔卜石兔台吉的大旗而来，一路所向披靡。卜石兔台吉的亲兵们也是拼了，百人小队迎面冲来，交错而过之后仅剩不到三十余人，除了郝永忠的左臂上被刀划了一口子，其余没事，这也是那个狡猾的亲卫队长用左手刀偷袭得手，结果也被郝永忠的亲卫一刀枭首。随后的战斗就如秋风扫落叶一般，面对生龙活虎的明军，残余的卜石兔台吉人马丝毫没有抵抗能力。
当郝永忠的亲兵提着卜石兔台吉的脑袋站到洪承畴前面时，洪承畴笑眯眯的问道：“谁干的？五百两白银的奖励，我自己出。”
郝永忠：“他，就是我的亲兵队长，一刀就把卜石兔台吉的......。”
亲兵队长可不敢争功：“不，不，是大人一刀......。”
“嗵，扑通”两声，郝永忠一脚把队长踢到：“我他妈还用和你争功吗？认.......。”
“嗵，扑通”又是两声，“郝永忠，你个王八蛋，告诉你不许领队冲锋，”洪承畴骂道，“不冲锋你会死啊，五百银子没你事了，队长领走，给弟兄们分了，罚你一个月俸禄，也送给弟兄们喝酒，叫你个王八蛋不听话。”
郝永忠带着亲兵捧着五百银子走了，洪承畴就带着士兵向西宁城会和袁崇焕去了。
奇涯温土司看到这仗打得太惨了，死人太多了，怕是回头有瘟疫传染，就从平戎城调来老百姓帮助收拾尸体，也不白干，每人一两银子，不到两天的时间就把这些尸体处理完了。
原来的卜石兔台吉的府中，袁崇焕正和洪承畴、奇涯温土司商量如何进行接下来的战事。奇涯温土司的意思是留下一部分人马驻扎在西宁城，一边适应青海这边的气候，一边继续向南进攻，等到达到青海南部时，如果攻击乌斯藏就必须换乘西藏马，否则战马就会死亡，人员也会因气候问题生病。袁崇焕开始也是为进攻方向问题头疼，青海面积太大了，他的兵马太少了，别说打仗，就是行军都够累的，现在奇涯温土司的建议刚好符合他的意思，就决定让洪承畴部扩兵，可能的话就地扩招一些士兵，毕竟还是本地士兵能够适应环境，免得无谓的损失。留下李过和五千步兵，并叮嘱李过遇事要多和奇涯温土司商量，自己也会把这些情况向皇上禀报，看皇上的旨意如何。
袁崇焕留下李过镇守青海，自己就带着洪承畴、李鸿基几人准备沿青海湖西侧一路向西南进军。奇涯温土司又建议袁崇焕换马，袁崇焕惊奇的看着奇涯温土司：“换什么吗？向西南去需要换马么？”
奇涯温土司说：“换乘本地的门源马，也许大人不知道，本地的门源马是西域的汗血马和原来本地的西凉马杂交培养的新马种，它集中了汗血马和西凉马两者的优点，耐力和速度都非常好，因为汗血马产在大宛国，故此这些马又叫西凉大宛马，三国时期的西凉铁骑就是用的这种马。我们祖上受洪武皇帝封为这里的土司，故此知道这件事，不过我只有一千匹这种马送给您，大人可以在门源附近购买一些，配给精锐的骑兵。”
袁崇焕听罢大喜，立刻说道：“土司大人如此慷慨，我必定奏请皇上为大人请功。”
