卢象升搞定中原之时，洪承畴在西北被搞得四脚朝天。
陕西境内的民军主要有李自成、蝎子块、过天星、满天星、混天星等几支，每支大约有三万人左右，人数远比进入中原的民军少。
但是离开了曹文诏和艾万年，洪承畴就是饭桶一个。从崇祯八年底到九年初，官军被民军牵着鼻子来了个环陕马术大赛，虽然也偶有杀伤，但是官军也损兵折将，没赚到什么便宜，宁夏还发生了兵变，导致巡抚王楫被杀，面对到处流窜的民军，洪承畴确实很“成愁”。
更为严重的是，在这场猫抓老鼠的游戏中，有一只老鼠逐渐修炼成精，难以制服。这只老鼠就是闯将李自成，在长期的游击战中，他磨练出了高超的生存本领和军事技能，若干年后，他将上演一场老鼠吃猫的好戏。
不过现在还不是闯将李自成的表演时间，现在的主角是闯王高迎祥。
闯王原本想到中原“海阔天空”一下，没想到被卢阎王紧追不舍，挨了一顿臭揍之后狼狈地逃入郧阳山中，在中原混不下去，高迎祥只得重回陕西发展，不久他就拉起队伍经兴安回到陕南山区。
高迎祥进入陕西以后，卢象升部官军齐集河南西部，堵住了高迎祥东出中原的路子，形成关门打狗之势，消灭高迎祥的任务就落到了陕西官军的头上，具体来说是落到了陕西新任巡抚孙传庭的头上。
孙传庭是山西代县人，万历四十七年（公元1619年）进士，历任永城知县、商丘知县、吏部验封司主事、稽勋司郎中等职，魏忠贤当道期间，孙传庭辞职回家，直到崇祯八年才复出，担任吏部封验司郎中、顺天府丞。
复出后的孙传庭对当前的剿匪局势十分关心，常指点江山，激扬文字，颇有澄清天下之志，被廷臣认为是一个不可多得的“边才”。崇祯九年三月，朝廷罢免了懦弱无能的甘学阔，起用孙传庭接任陕西巡抚。
崇祯对孙传庭寄予厚望，临行前亲自召见了他，一番寒暄之后，孙传庭提出了兵饷不足的困难，请求皇上支持。
崇祯表示钱没有，政策倒是有一条。这个政策就是孙传庭可以采用多种形式，自行筹措经费，用以招兵买马，朝廷不加干涉。
经验证明，给政策往往比给钱更有用。政策是来钱的渠道，有了渠道，何愁没钱？当然，好政策也要有人去落实才行。
孙传庭到陕西以后，自力更生，艰苦奋斗，按照“以秦兵卫秦地，以秦地养秦兵”的理念，实行屯田，发展经济。经过治理，年收税银14．5万两，米麦1．35万石，孙传庭以此招募训练了一只劲旅。
崇祯对此十分赞赏，下旨褒奖，并号召全国巡抚学习孙传庭好榜样，解决兵与饷两大难题。
在搞好经济建设的同时，孙传庭在军事上也取得了骄人的战绩。上任不久，他就令副将罗尚文率明军进击商洛地的民军，诛杀了整齐王，解决了前任巡抚甘学阔长期解决不了的问题。
高迎祥进入陕南后，洪承畴与孙传庭进行了工作分工，洪承畴重点对付陕北一带的李自成等部，孙传庭则重点对付高迎祥。
高迎祥部退入陕南山区之后，在荒山野岭无处觅食，人饥马乏。为摆脱困境，他决定走小路进攻西安，给官军来一个突然袭击。孙传庭对此早有预料，在闯王必经之路周至县黑水峪设置伏兵，准备以逸击劳。
崇祯九年七月中旬，高迎祥部果然出现在周至黑水峪，进入了孙传庭的包围圈，双方展开了四天的激战，此时天降大雨，高迎祥部己经连续多日断粮，人马处于半饥饿状态，在大战中渐渐招架不住，官军的包围圈越来越小。
关键时刻，高迎祥部下乾公鸡张二、一斗谷黄龙叛变。混乱中，叛徒将高迎祥的部卒和坐骑拉走，高迎祥被官军包围无法脱身，只好脱下盔甲藏到草丛里，官军搜山将其活捉。
崇祯得知高迎祥被俘的消息兴奋不己，命令将高迎祥押往北京举行献俘仪式，仪式之后高迎祥被凌迟处死。
俘杀高迎祥之后，孙传庭又乘胜在渭南和咸阳北原打了两个大胜仗，一时声誉雀起，威名甚至盖过了总督洪承畴。
高迎祥的败亡对民军起到了震摄的作用，两位著名的首领张妙手（张文耀）、蝎子块（拓养坤）向明朝投降。不久蝎子块复叛，被孙传庭安插的奸细武大定杀死。
高迎祥是民军中实力最强的，蝎子块则是民军中人数最多的，这两人都死于孙传庭之手，这对民军是一个沉重的打击。
崇祯九年上半年，国内镇压民变的战争取得了很大的成效，东南战场上卢象升把民军赶入深山，西北战场上孙传庭擒杀高迎降，把民军打入冬眠期，形势一片大好。
