林大猛接管水师后，收编了原福州水师、泉州水师的二万官兵，沐英又补充了一万老兵进去，新编的水师对外统一称福州水师。林大猛接管水师后，接到的第一个指令是，沐英要求他带着水师，到泉州消灭泉州水师余部，协助汤和将军进攻泉州，林大猛领命而去。
沐英同时给应天城的朱元璋写了一封战报，用快马送去。
内容是：其一、介绍福州的战事经过；
其二、建议重新组建福州水师和泉州水师，将巢湖水师的部分官兵，编入新组建的两个水师中，起到控制的作用，实际上江南江北统一后，巢湖水师的用处就不大了；
其三、建议组建闽东四府，与闽西四府相对应，这样福建八府的格局基本形成了；
其四、对福建降将赖政、林大猛、黄缇敏、施永明与邓思苟等，请求大胆使用，并将陈友定父子，及谢英辅、陈宗青、黄永泰、完者帖木儿、曲引、那虹那曲等战俘，不日将解押到应天城，请义父定夺；
其五、福建全省拿下后，建议汤和将军趁机进入粤省，一举平定东南一带。
朱元璋的回复，很快就到了，对福建战局在这么短的时间内，就达到了控制全局的目的，很是欣慰，对汤和、沐英等大加赞赏，对有功将领由沐英、汤和报上来，论功行赏。
同意组建福州水师和泉州水师，并令缪永安为水师统帅，节制福州水师和泉州水师、巢湖水师，林大猛为福州水师统领，俞通海为泉州水师统领，张德胜为巢湖水师统领。并将巢湖水师分一半，并入福州水师和泉州水师中。
令赖政为福州将军、黄缇敏为福州知府、施永明为宁德将军、邓思苟为龙岩将军。陈友定等重要的被俘头目，全部押解到应天城，听候处理。
同意增设闽东四府，福州府、兴化府、泉州府、漳州府。这样，与闽西四府合起来，为闽地八府。地方吏员由沐英在当地斟酌安排，主要官员，由即将成立的大明朝吏部派出。
朱元璋最后告诉沐英，福建战事结束，沐英迅速组建各府治、县衙，确保地方的稳定后，迅速回应天城，接受新的职位安排，至于是什么职位，函件中并没明说，只是告诉沐英将自己所部，分别安排在沿海一带驻扎。
沐英派人给姑苏城的陆宇庭大哥，写了一封书信，让他带着陆家的漕运船队到福州来一趟，同时也通知了姑苏城的另三大家、丹徒城的三位族长，和定远城陈家陈老先生，让他们到福州来一趟。
顾德强和潘成龙拿下了兴化城后，再拿下德化、永春两城，留下五千人驻守兴化城，再分别派出三千人驻守德化、永春两城，身边就只剩下了不到二万人，再去攻击泉州周边的安溪、南安，就显得兵力不足了。
陈实派人送来了沐英的指令，另二人在兴化、德化、永春一带固守，等待大军到来，然后配合大军拿下泉州。
林忠豪带着四万五千大军包围了龙岩城，经过一整天的激战，拿下了龙岩城，俘虏敌军八千余人，林忠豪没有安排军队驻守龙岩城，而是将八千士兵俘虏打散后，重新编入了大军中，是原来的四万余人，扩编至五万余人。
然后，由陈琪率一万五千人取漳平城；张雨桐率一万五千人取华安城：刘德胜率一万五千人取永安城。而林忠豪却率八千人向南靖城方向警戒，阻击援军。
陈琪率军队攻下了漳平城后，直接攻向长泰城，解决漳州南面之敌；张雨桐率军队攻下华安城后，再转攻向南靖城；刘德胜率军队取永安城后，再转向平和城；林忠豪率八千人也来到了泉州城外的九龙江畔。
各部分别清剿了漳州周边的几个小城后，按照约定将漳州城团团的围困了。
漳州守将何碧青，城内守军共二万余人，早在龙岩城破时，何碧青就得到了消息，无奈自己拢共才二万余人，心有余而力不逮，只能固守漳州城，现如今冰凌城下了，反而不着急了，因为抵抗也是个死，不抵抗反而还有条活路，所以，他将部下召集在一起，商量投降。
没想到在座的几名部下，一致赞同投降，原因很简单，现如今朱元璋统一了大江南北，连元朝皇帝都赶走了，朝廷都不在了，还卖个毛的命，谁来管你啊。大家都有家眷，还是保命要紧，何况朱元璋的新朝马上建立，没准还能有个一席之地呢。
林忠豪的火炮、重弩、火铳刚一摆开，还没等下达攻城令，城内就挂起了白布投降了，搞得陈琪、张雨桐、刘德胜三将很是失望，搞啥子毛哟，好歹打一场再投降嘛。
林忠豪将手中的八千士兵，与何碧青的两万士兵一勾兑，编成了两卫，何碧青带一卫，何碧青的副将郑佳鹏带一卫。留下陈琪带着一万五千人守漳州，自己带着张雨桐、刘德胜、何碧青、郑佳鹏，四卫六万人马直奔泉州而去。
经过厦门城时，顺带着收并了厦门的一万兵马，原来厦门守军黄世伟将军，是郑佳鹏的表亲兄弟，郑佳鹏站在城外一吆喝，黄世伟立刻就降了。
林忠豪让黄世伟继续镇守厦门城，他手下的一万士兵也没有动窝，继续在厦门城，待福建战事接受，同意接受军部的调遣。林忠豪带着六万人继续朝泉州方向而去。
汤和将军率五万大军到了永清城，与王顺、潘成龙、顾德强汇合了，汤和说：“小子们，小沐子让你们听从我的指挥，一起拿下泉州城，有意见没？”
王顺等人都知道汤和与朱元璋的交情，连沐英都喊他叔，其余的人也都跟着喊汤叔了。汤和乐的嘴都合不上了，这么多的小伙子围着他、恭维他，很受用的样子，他大手一挥：“走，向泉州进军！”
汤和让潘成龙攻下安溪城后，再直插清源山东边的洛阳江边；顾德强拿下南安城后，再直插到泉州南边的鲤城；唐三明去取惠安城后，到达洛阳江边与潘成龙汇合；自己却率大军直达泉州北面的清源山。
这时，林忠豪的六万大军已经拿下了晋江城、石狮城后，留下张雨桐镇守石狮、晋江两城，自己率四万五千人来到了泉州城东的晋江边。
泉州城南面是大海，东面是洛阳江、北边是清源山、西边是晋江。城内守军三万余人，守城大将是陈世冠，自打陈宗海带领一万精兵、百来艘战舰离开泉州后，陈世冠就很仔细的观察，泉州周边的军情动态，小心翼翼的固守着泉州。
海上还有支一万人的泉州水师，水师将领是郑武，这支水师常年在海上游弋，陈宗海带走了大批的水师战舰离开泉州后，郑武就率领这支五十多艘战舰的编队，停在了泉州湾，随时准备策应泉州城的防务。
泉州北面是汤和将军的三万人；东面是潘成龙的一万五千人和唐三明的一万人，其中五千人留守在惠安城；西边是顾德强的一万人，其中五千人留守鲤城；林忠豪的剩余四万人渡过晋江后，直接到了泉州南门的海边。
林大猛率领二万水师，分乘二百艘战舰，在泉州湾外的马头岛附近一字摆开，封锁了泉州湾，将泉州水师堵在了泉州湾里。
其它三面都开始了攻城，在海边的林忠豪也下达了攻击令，刘德胜、何碧青的两卫人马开始了攻城，郑佳鹏带着一卫人马在海边岩石后警戒。
泉州城一开打，泉州水师就坐不住了，水师统领郑武命令水师五十多艘战舰起锚，向泉州南岸靠近。
林大猛接到泉州水师向泉州南移动的禀报后，便命令水师快速的向泉州水师压过去，于是，二百多艘战舰纷纷起锚，平行的向泉州而去。
到了泉州南岸，郑武便命令战舰上的士兵，开始登陆，准备向林忠豪的背后发起攻击。一万水师官兵开始放下小船，然后一批批的士兵向岸上划去。
忽然，一名参将禀报：“郑大人，快看海上！”正在观看泉州城攻城战的郑武，闻言回头一看，远处的海平面上，密密麻麻的战舰平行的向泉州方向而来。
郑武说：“是陈宗海大人率队回援泉州了！”他从没怀疑这是明军的舰队，因为朱元璋只有一支巢湖水师，而巢湖水师只是内陆战舰，内陆船只是平底船，到海上来很容易倾覆，更不谈作战了，根本就不及海船的优势。
郑武一边命令士兵们继续登陆，一边大声喊道：“陈大人带着舰队主力回来了，泉州有救了！”正在登陆的士兵们一听，精神更足了，划着小艇，拼命的向岸边划去。
