正文叙述了一件凄惨悱恻的故事：
北宋末年，山河破碎，蒙古大军铁蹄横扫神洲，江南汉族人成为最下等人，受尽欺压**。青年侠侣郑智龙，关三娘怒斩欺压良善的元朝官吏，驾船出海，躲避追缉，后在鸳鸯岛定居。
郑、关二人定居荒岛，劳做之余，百无聊赖，便整日精研武功，打发时光。
修习内功，讲究阴阳平衡，阴阳诸经要依次修习，否则重则走火入魔，轻则全身瘫痪，武功尽失。然而若依贯例依次修习，阴阳互为抵消，进境甚慢。因此，修习勤奋的，四五十年后方有大成，略有懈怠的则终生一事无成。郑、关二人武学底子甚好，又兼智慧过人，偏要挑战前人结论，郑智龙专修阳脉，吴三娘专修阴脉，果然进境神速，未及半年，功力大进，但随之二人俱有走火入魔之象，二人细思破解之法，竟然另僻蹊径，练就合籍双修，互渡阴阳之术。不仅解了走火入魔之厄，还使枯燥乏味的内功修练变得风光旖旎，引人入胜。二人发奋用功，进境一日千里。未及十年已然大成。由于这项内功的修练必须是夫妻二人合练，故以鸳鸯名之。随后二人又依据鸳鸯门内功特点创下剑术、暗器、拳法和轻功等功夫。
武功大成后，二人回到中原，寻各路高手比试，竟然如汤沸雪，所向披糜。期间元兵闻得风声，集兵捉拿，郑关二人毫无惧色，与元兵多次交手，斩杀元兵无数。杀得兴起，二人夜入皇宫欲行刺元帝，二人杀个三进三出，如入无人之境，虽未寻到元帝，却也抢得无数珍宝。朝庭震怒，调兵遣将全力缉拿，二人这才扬帆出海，回到鸳鸯岛。
二人年逾四十方生下一女，取名美英。二人视若掌上明珠，倍加宠爱，使她从小养成了刁蛮任性，强横骄纵的性格。
一晃又匆匆过了十几年，美英已出落得如出水芙蓉一般，但性格却刁钻古怪，顽劣异常。期间虽然也跟随父母修习武功，但一来贪玩，二来无法修习鸳鸯门的武功，修为自也泛泛。眼见美英一日日长大，郑关二人暗暗着急，一是美英已到及笄之年，二来也急着将鸳鸯门的衣钵传给她。
一日，一家三口收拾行装再次来到中原，名为游历，实为美英终身而来。美英却全然不知，只知自己玩得高兴。
一直寻觅了两个多月，才在杭州找到一位叫曹梦雄的少年，这少年根骨之佳，悟性之高连郑关二人都自叹弗如，假以时日必成大器。郑关二人象是发现了奇珍异宝，高兴得合不拢嘴，岂知这却是悲剧的开始。
郑关二人只顾寻觅弟子，却忽略了美英的感受，曹梦雄虽然是练武的绝佳材料，却是其貌不扬，瘦小枯干，眯缝眼，低鼻梁，厚嘴唇，两耳招风，且言语木讷，实非美英佳配。初上鸳鸯岛，美英并不知个中奥妙，见多了个玩伴，还欢喜无限，郑关二人见了心中暗自高兴，时机未到，也不说破机关，每日督促二人修习鸳鸯门内功。
郑关二人由于有极好的内功底子，专修阴阳用了半年的时光，而美英和曹梦雄却是足足用了两年光阴，饶是如此，郑关二人也是大喜过望，比他们预计的要早一年多时间。
郑关二人见美英和曹梦雄都已有了走火入魔的迹象，以为已经水到渠成，遂公布了二人的婚事，不料美英当即一口回绝，大闹不止，但是箭在弦上，性命攸关，又没有时间更改，所以尽管美英百般不愿，但终究父命难违，强拧着脖子与曹梦雄结了婚。但阴阳双修之术要求男女二人必须情投意合，心意相通，其关键窍要在于互为对方着想方能阴阳互渡。而美英在洞房之内厌恶已极，如同受刑一样，拧着鼻子扭着脸，何尝想过对方？而曹梦雄也是外和内刚，若不是师傅严命，也极不愿拣这现成便宜。二人同床异梦，便未能达到郑关二人的境界，反倒引得虚火上升。但饶是如此，因二人是极阴极阳交合，倒也解了二人的走火入魔之厄，但功力却未能因此而大进。
一连数年，郑关二人见小俩口感情不合，时常吵闹，而且武功进境甚慢，大惑不解之余，心情甚是烦恼，未及七十，二人便相继抑郁而终。
郑关二人在日，美英迫于压力对曹梦雄尚能稍假颜色，父母一死，她再无顾忌，不久二人关系便恶化得难以收拾。美英至北山另寻一洞定居，从此不与曹梦雄往来。二人此时的内功修为已经达到一流境界，只是不能合籍双修，难以更上层楼，因为分居，二人均不敢再继续修习鸳鸯门的内功。然而内功修为达到了他们这个境界，即使走路、睡觉内功也会自行增长。开始两年，二人但觉心情烦燥，尚不明所以，再过数年，竟是血脉贲张，时常头昏眼花，已有了走火入魔的迹象。二人俱是聪明绝顶之人，细加推究，已明其理。期间曹梦雄从大局出发，多次去找美英修好，然美英心高气傲，不为所动，被劝得烦了，索性寻了一块巨大的石板，做成石碑，并刻了“山界”二字，立在小路中央，以示决绝之志。
为克制体内真气泛滥，二人不约而同奔赴中原，寻求各门各派的内功修习之法，回岛后再细加钻研。美英因缘适会，盗得苗疆百花门内功心法，推究心法中的男女采补之术，阴阳调合之法，寻到一条解决走火入魔的办法，习练之后，竟暂时消除了燃眉之急，但是内功却再无进境。习练日久，竟而性情大变，更加偏激，将自己一生的痛苦尽数怨在父母身上，所想所做与父母要求尽皆背道而驰，不仅自创了一套不堪入目的鸳鸯拳，还故意收了一对同胞兄妹同时习练，用心甚是邪恶。
曹梦雄虽然也抢得几本密笈，却始终未能思出破解之法。后来无意中得到一本毒谱，依谱选了几味阴柔毒药，以毒攻毒，免强镇住阳毒发作，但心中自知这是饮鸩止渴。
期间曹梦雄多次到北山窥视美英师徒练功，详加研究，觉得美英的办法亦非善策，虽然能暂时将阴毒压制在脾脏底部，但将来一旦压制不住，便会突然暴发，汹涌而至，那时便是大罗金仙也束手无策了。况且，阴毒长期郁结，必使人伤失理智……
曹梦雄遗书共有十几页，将前因后果描述得颇为详细，在结尾写道：“呜呼、鸳鸯门弟子遗弃旷世之神功，却盗抢他人之密笈，不亦悲呼？近日体内真气沸腾，痛苦万状，知无可抵御，死期将至矣，然有何面目见先师于九泉？临亡之际，遗书世上，有缘人阅之，引为噬肤之戒。若能修得正果，光大吾门，则梦雄感激涕零，含笑九泉矣。”
