在故宫东部的宁寿宫以南，有一座红墙绿瓦的宫殿，称为南三所，在清朝是皇子居住的地方。南三所的前身即明代的慈庆宫。明万历三十八年(1610年)十二月，崇祯皇帝朱由检出生在这里。
朱由检的父亲是泰昌帝朱常洛，祖父是万历帝朱翊钧。由于万历帝偏爱郑贵妃所生的三子朱常洵，王宫女所生的长子朱常洛太子地位一直不稳，他的孩子们自幼也未能得到正常待遇。
朱常洛做太子时共生有7子，5个夭亡。长子朱由校15岁时，生母王才人被父亲宠爱的“西李”(住在西宫的李选侍)殴打致死。五子朱由检5岁时，生母刘淑女受父亲责罚含冤死去。这两个没娘的孩子都被交给恃宠专横的“西李”“抚养”。
好不容易熬到万历帝死去，朱常洛即位为泰昌帝。但因身体虚弱又纵欲过度，只当了一个月皇帝即死去。16岁的长子朱由校即位为天启帝后，控诉“西李”说：“选侍侮慢凌虐，朕昼夜涕泣。皇考(父亲)自知其误，时加劝慰……朕之苦衷，外廷岂能尽悉。”兄长尚且如此，同样在“西李”“抚养”之下的弟弟朱由检所受待遇可想而知。
天启帝登基后，立即将小他5岁的弟弟改让“东李”(父亲的另一个李姓选侍，因住东宫而称“东李”)抚养，并在次年封弟弟为信王。于是朱由检随着庶母“东李”又住进出生地慈庆宫。朱由检每日早晨先要拜天，然后给庶母请安。当他思念生母时，就避开权宦魏忠贤的监视，暗地拿些银两委派亲信太监去西山坟地代祭，并再三嘱托：“尔可祝告明白着，就如我亲去恭祭一般。”天启五年，“东李”被魏忠贤迫害而死，朱由检的日子更加难过。
天启七年，23岁的朱由校病死，他没有后代，由18岁的弟弟朱由检即位为崇祯皇帝。崇祯皇帝追尊生母为皇后，将灵柩迁往庆陵与父亲合葬，但他已记不起生母的模样。《明史》说，崇祯帝请外祖母指点画工画了生母的像，由正阳门迎入皇宫午门，让老宫女们辨认。结果有人说画得很像。有人说画得不像。崇祯帝听后跪地不起，泪如雨下。
