一、【融合召唤】
游戏王系列作品中的最经典召唤形式，于本作第二话龙霸与游乐进行决斗时首先被使用，一开始是在天马决斗学院的精英班所教授的珍贵召唤方式，后在学院里比较普及，之后只有在天马选修班----‘融合课程班’才能学到，是天马的三大支柱之一。
召唤规则：属于特殊召唤。融合素材在自己的手牌、场上或墓地集齐，且怪兽区域有空位的时候，宣布发动【融合】魔法卡或具有类似效果的卡（比如【奇迹融合】、【暗黑融合】、【龙之镜】等），把宣布发动的【融合】正面摆放在魔法陷阱区域内。确认【融合】的发动和效果有效后，把融合素材送去墓地，从额外卡组取出相应的融合怪兽，正面攻击表示或者正面防守表示摆放在场上，最后将【融合】送去墓地，融合召唤结束。
召唤对象：额外卡组里的融合怪兽
使用举例：武田龙霸（上级使用者→融合操纵者）
“发动魔法卡【融合】，我把手牌中的【龙之支配者】和【神龙·末日光】融合，从光芒的起源，穿越到黑暗的尽头，融合召唤！诞生吧！【龙魔人·龙骑士之王】（龙族/融合，七星，暗属性，攻2400，防1100）攻击表示！”龙霸使出了【融合召唤】。
二、【超量召唤】
游戏王系列作品中使用较为广泛的，比较新型的召唤方式之一。于本作第十话影丸与游乐进行决斗时首先被使用，是天马决斗学院的精英班所教授的珍贵召唤方式，之后只有在天马选修班----‘超量课程班’才能学到，是天马的三大支柱之一。
召唤规则：属于特殊召唤。在场上有两只以上的同等级怪兽，而怪兽等级和欲召唤的超量怪兽的阶级一致，且满足超量怪兽自身召唤条件和素材数量的使用限制时，在玩家的主要流程可以宣布进行超量召唤。在召唤不被无效的情况下，怪兽被作为叠放素材（超量素材）不用送去墓地而是叠在一起，从额外卡组取出相应的超量怪兽，以表侧攻击表示或表侧守备表示叠在那些怪兽的上方超量召唤出场。
召唤对象：额外卡组里的超量怪兽
使用举例：黑泽影丸（超量操纵者）
“我把场上的两只等级八星的【神龙之圣刻印】叠放，两只怪兽构筑叠放网络，从光辉的尽头诞生，用雷电将敌人粉身碎骨吧！超量召唤！阶级8，【雷霆终结龙】（龙族/超量，八阶，光属性，攻3000，防2000）攻击表示！”影丸使出了【超量召唤】
三、【同调召唤】
游戏王系列作品中使用较为广泛的，比较新型的召唤方式之一。于本作第八话织子与超凡进行决斗时首先被使用，是天马决斗学院的精英班所教授的珍贵召唤方式，之后只有在天马选修班----‘同调课程班’才能学到，是天马的三大支柱之一。
召唤规则：属于特殊召唤。当场上集齐同调召唤所需的素材（调整怪兽和非调整怪兽），而所有怪兽等级合计等于欲召唤的同调怪兽等级，且满足同调怪兽自身召唤条件和素材怪兽的使用限制时，在玩家的主要流程可以宣布进行同调召唤。在召唤不被无效的情况下，把同调素材送去墓地，从额外卡组取出相应的同调怪兽，以表侧攻击表示或表侧守备表示特殊召唤上场。
召唤对象：额外卡组里的同调怪兽
使用举例：上杉织子（同调操纵者）
“我把场上的三只等级二星的【神圣球体】，和等级二星的调整怪兽----【神秘之代行者·厄斯】，调星！”（2 2 2 2=8），从天空降临人间的圣骑士啊，用你的正义之光，照亮所有被黑暗笼罩的地方吧！同调召唤！等级8，神圣骑士·珀耳修斯（天使族/同调，八星，光属性，攻2600，防2100）！攻击表示”织子使出了【同调召唤】
四、【数码召唤】
只有在本作中才能见到的召唤方式，是主角----星游乐依靠寄存在数码电表里的源数代码的力量，所创造出来的新召唤方式。于本作第三话游乐与龙霸进行决斗时首先被使用，是天马决斗学院从未教授过的召唤方式，原本是只属于主角一个人的召唤方式，但在第十九话被MAX组织成员----MAX·D所使用。
召唤规则：属于特殊召唤。当额外卡组没有卡存在时，同时手牌中有数码怪兽时，可以将额外卡组作为数码区域使用。之后可以在自己的主要阶段将手牌、除外区域的数码怪兽设置在数码区域（就是表侧进入额外卡组）。设置在数码区域的数码怪兽，可以发动它们对应的数码效果，同时只要满足对应数码区域中的，数码怪兽的数码召唤条件，在玩家的主要流程可以宣布进行数码召唤。在召唤不被无效的情况下，从数码区域取出相应的数码怪兽，以表侧攻击表示或表侧守备表示特殊召唤上场。（数码怪兽的特性：在场上被破坏时，不送入墓地，直接除外）
召唤对象：数码区域中的数码怪兽
使用举例：星游乐（上级使用者→数码操纵者）
设置数码卡：“当自己的额外卡组没有卡时，并且手牌中有数码怪兽的时候，可以将额外卡组，作为数码区域！”游乐将两张手牌放入了额外卡组，“我将手牌中的数码怪兽----【源数战士】和【代码暴龙】设置在数码区域！”
进行数码召唤：“当自己场上的怪兽卡数量比对方少的场合，源数战士可以从数码区域特殊召唤；当自己魔法陷阱区域的卡比对方少的场合，代码暴龙可以从数码区域特殊召唤！我现在场上没有任何卡，满足数码召唤条件！转动吧！魂之数码电表，以更快的速度，转动吧！数码召唤！出现吧！我的数码怪兽们----【源数战士】（战士族/数码，四星，暗属性，攻1600，防800，DIY），【代码暴龙】（恐龙族/数码，五星，暗属性，攻1500，防2000，DIY）！”游乐使出了【数码召唤】
五、【仪式召唤】
游戏王系列作品中比较局限的召唤方式，在多部作品中客串出现，属于经典召唤方式之一。于本作第十三话海斗和次郎、志远，一对二决斗中首先被使用，是天马决斗学院的公选课之一，重要性仅高于上级召唤（属于通常召唤），每个班都能学到。
召唤规则：属于特殊召唤。仪式怪兽及其注明的特定的仪式魔法卡在手卡中集齐，主动宣告发动此仪式魔法卡，把宣布发动的仪式魔法卡正面摆放在魔法陷阱区域内；确认此仪式魔法卡的发动和效果有效后，按照其记述的内容，从自己场上·手卡将直到变成与仪式召唤的仪式怪兽等级相同为止的怪兽解放，将手卡中对应的仪式怪兽正面攻击表示或者正面防守表示摆放在怪兽卡区域，最后将此仪式魔法卡送去墓地，仪式召唤结束。
召唤对象：手牌中的仪式怪兽
使用举例：滨海斗（仪式操纵者）
“发动仪式魔法----【遗式的仪水镜】，我把场上等级四星的【万手神】和手牌中等级二星的【遗式深渊鲨】解放，这样就可以从手牌特殊召唤等级六星以下的仪式怪兽了。从海底的深渊觉醒过来，用漩涡让敌人沉睡吧！仪式召唤！降临吧！等级6，【邪遗式四臂噬人魔】（水族/仪式，六星，水属性，攻2600，防2100）”海斗使出了【仪式召唤】
