朱棣大封功臣之时又下令逮捕诛杀建文朝那些誓死不肯归顺的逆臣，这期间有很多的建文朝旧臣不甘受辱，在狱中自行了断。
朱棣见到这些建文朝旧臣宁死也不屈服，是又敬又恨，心道：“允炆这小子竟有这么多人效忠赴死，他死了也算值了。哼，敢不服从朕者，杀无赦，朕要灭了这些人九族，看看天下还有谁敢不服朕，谁敢对朕不忠心？”
朱棣又想，“如今朕手握神器，当选个吉日召告天下，正式登基为帝，但该由谁来起草诏书为好呢？”当下朱棣宣道衍和尚入殿，将此事问之于他。
道貌岸然的道衍和尚笑道：“请问皇上，当今天下谁是读书人的表率？”
朱棣道：“你难道说的是方孝孺，叫他来起草诏书？”
道衍和尚道：“方孝孺乃当世第一大儒，得要皇上亲自去请他才显得皇上有诚心。”
朱棣笑道：“对，对。理当朕亲自去请。”
道衍和尚方告退离去。
朱棣迫不及待的赶去了关押方孝孺的牢房，见到了方孝孺，命人赶快打开他身上的枷锁，对着牢房狱卒骂道：“大胆，怎可如此对待先生？”
方孝孺冷冷道：“朱棣，你少假惺惺，要杀便杀，少给老夫来这一套。”
朱棣道：“先生说的甚么话，朕又岂舍得杀你，那不叫天下读书人寒心？”
方孝孺道：“朕？看来你燕庶人的阴谋果然得逞了。”
朱棣道：“正所谓国不可一日无君，承蒙朝中大臣们和各地的藩王们共同拥戴朕登基为帝，朕惟有勉为其难了。”
方孝孺道：“好一个勉为其难，你如今既已得偿所愿，还来找老夫作甚？”
朱棣道：“朕此来实是有一事相求于先生。”
方孝孺道：“你已然篡位成功，还会有事相求于老夫这阶下之囚？”
朱棣道：“先生文章冠绝天下，又是天下士子的表率，朕想求先生为朕写一道继位诏书，诏告天下，正式登基为帝，年号就叫永乐。”
方孝孺听罢仰天大笑不止。
朱棣道：“先生为何发笑？”
方孝孺道：“往日我骂你是乱臣贼子，今日却要我对你歌功颂德，岂不好笑？”
朱棣强忍怒火道：“此一时，彼一时也。正所谓识时务者为俊杰，先生更应该明白这个道理。”
方孝孺想了想道：“好，我写。”
朱棣大喜道：“来人，快准备笔墨。朕要亲自为先生磨墨。”笔、墨、砚台奉上，朱棣果然亲自磨墨，心中暗喜：“方孝孺这老学究终于开窍了。”
方孝孺挥笔在黄绢上写了四个大字，朱棣看到这四个字终于压不住了心中怒火，大吼道：“岂有此理，方孝孺，你不想活了？”
他愤怒之下一拳打向牢房墙壁，那墙壁竟破了一个大洞。整个牢房都在颤动。好重的一拳，这一拳得有多大的力量？朱棣果然不愧为燕军中第一高手，也难怪他身经百战，每次都能死里逃生，成就今日之帝王霸业。
方孝孺毫不畏惧，凛然道：“忠臣不侍二主，老夫早就抱定必死决心，又岂会向你这乱臣贼子屈服低头？乱臣贼子，哈，哈。”原来那四个大字正是“乱臣贼子”四字。
朱棣再次强压下怒火，道：“先生为何如此仇恨我朱棣？朱棣不过是顺应天意，无奈之下才发动了靖难之役，实则是为皇上清君侧，诛奸臣小人，然而建文皇帝竟误解了我朱棣，竟然焚火自尽。国不可一日无君，朱棣只能受命于危难继承大统，以告慰我皇考在天之灵。”
方孝孺道：“好个虚伪令人恶心的小人！朱棣，燕庶人，你听着，你篡夺神器，千古罪人，老夫死便死罢，诏不可草！”
朱棣怒目圆睁，喝道：“你死便死罢，朕又岂能让你速死？便是死，就不怕朕株连你九族？”
方孝孺大笑道：“株连九族？哈，哈，便是十族，又如何？”
朱棣气得是六窍生烟，怒指着方孝孺道：“好，好，朕便如你所愿，诛你十族。”
方孝孺大笑道：“你这奸贼，必遭雷击，你败于我也！”
朱棣气得连连喘气，喝道：“来人，将方孝孺即刻押往刑场，给他凌迟处死，朕要看着他慢慢的受尽折磨而死，另外将他十族之内的亲属好友和学生，只要是跟他方孝孺有一点点关系的统统给朕杀了！”
就这样方孝孺所有的亲人好友和他的学生全都被押往刑场受死。刑场上几百口性命背缚着，跪在刑场上，等着行刑。方孝孺望着弟弟方孝友老泪横流，哭着道：“兄弟，是做哥哥的连累了你啊！”
方孝友道：“兄长不必难过自责，为国而死，弟弟死得其所，能够与兄长一同赴死是弟弟的福份。临行之际就让为弟为你做一首绝别诗：阿兄何必泪潸潸，取义成仁在此间。华表柱头千载后，旅魂依旧到家山。”
方孝孺听罢更是泪如泉涌，道：“好，好，哥哥以你为傲。朱棣，你这乱臣贼子，你不得好死！”随着行刑号角响起，监斩官下令行刑，方孝孺受尽千刀致死，惨状实不忍睹，那几百口性命也在倾刻间魂归地府。
应天城破，建文朝廷灭亡，朱棣如愿得登大位，而身在军营之中的铁铉将军亦不幸被叛徒出卖，为燕军所俘。
说到铁铉，堪是朱棣的宿敌，永乐皇帝朱棣生平最为痛恨、害怕又最是敬佩之人便是铁铉，当今天下也唯有铁铉能与朱棣在战场上一较雌雄。
铁铉，用兵如神，靖难之役四年来，铁铉与朱棣数次在战场上正面交锋都大败朱棣，有好几次更是差点就要了朱棣的性命。若不是建文帝听信了他人之言，中途撤换掉铁铉，改任李景隆为帅，朱棣不见得能够篡位成功。
铁铉被燕军押至金銮宝殿内，朱棣见到这位宿敌，决定亲自会会他。他虽然痛恨惧怕铁铉，但更爱其才，很希望铁铉能为己用。朱棣高坐在龙椅上，看着阶下的铁铉背对着自己，不免心有怒气，道：“铁铉，你也有今日？”
铁铉恨恨道：“只恨战场之上没能杀了你这奸贼，数次都让你逃了。”
朱棣道：“你可知道你数次差点都置朕于死地，而朕为何都能化险为夷吗？那是因为朕乃是天命所归，上天都在助朕，我皇考在天之灵也在庇佑朕。朕今日能得登大保，实乃顺应天意，谁都不能逆天行事，你铁铉也不能。所以朕劝你还是归降于朕，朕保证绝不计前嫌，加封你为我朝兵部尚书。只要你肯向朕屈服，正对着朕磕三个响头，高呼三声万岁。一切的荣华富贵和功名利禄就全是你的。”
铁铉大笑道：“铁某人岂是贪图荣华富贵之人？朱棣，你太小看铁某了，也看低了你自己。”
朱棣无奈道：“你是不打算正面看朕一眼了？”话中尽是威胁。
铁铉凛然道：“你便是割下我的耳鼻我也不会正面看你。”
朱棣怒道：“这可是你自己说的，来人，割下他的耳鼻，放入炉火中烧烤，朕要看看你铁铉敢不敢吃下自己的肉。”
锦衣卫指挥使纪纲亲自动刀，铁铉瞬间满脸血肉模糊，惨不忍睹，但铁铉却没有发出痛叫声。不久，耳鼻即在炉火中烤熟，闻到一股香味。
纪纲亲自端到铁铉面前，铁铉赞道：“好香。”张开嘴一口气吃下自己的耳鼻。
朱棣问道：“好吃吗？”
铁铉道：“忠臣之肉当然好吃。”
朱棣道：“你还是不肯正面看着朕？”
铁铉道：“若是正面看着你这奸贼，岂不要脏了铁某人的双眼？”
朱棣气得从龙椅上跳起，道：“好，来人，挖去他的双眼。”
纪纲动作利索，一下子就挖出了铁铉的双眼。
铁铉大笑道：“朱棣，你终究还是败于我手，铁某人是永远不会正面看你的了。”
朱棣道：“朕自有办法让你正面对着朕。来人，将他投入油锅内给炸了。”
油锅抬到了大殿之上，很快便生了火，不久锅内的油便滚滚翻腾。两名锦衣卫将铁铉整个人抬起投入油锅内，铁铉很快被生生炸熟，奇怪的是屁股朝着上面，他至死也不正面看着朱棣。
朱棣下了龙椅亲自过来看，命人将铁铉翻过身来，奇怪的是锦衣卫一放手，那铁铉的身子竟又自动翻回去屁股朝着朱棣，始终不正面见朱棣，朱棣仰天大叫：“天意，天意！”
永乐皇帝朱棣登基后，并没有从此高枕无忧的坐拥江山，他始终害怕自己的帝位不过是一场梦而已，而建文帝朱允炆根本就没有被火烧死。
他怀疑建文帝尚在人间是有他的理由的，一是民间各地都传来发现建文帝的踪迹，虽多是捕风捉影，却令朱棣相信建文帝的确还活着；二是宫内所谓建文帝的那具烧焦了的尸体经太医查验实为一具女尸，非是建文帝的遗骸，尽管吕太后一口咬定那就是她儿子的尸身，但朱棣更愿意相信太医精准的查验结果；三是朱元璋在位之时曾留有十七块宝玺，但朱棣只得到了当中十六块宝玺，而最为重要的一块传国玉玺却不知所踪，他怀疑是建文帝朱允炆带走了。
如果朱允炆真的尚在人间，而这第十七块传国玉玺又真的在允炆身上，那他朱棣的这个龙位便坐得不得安稳。传国玉玺所带表的正是皇权，有了它便可以号令天下，统领天下兵马，它若是在建文帝朱允炆的身上，那他朱棣的这个皇帝便名不正言不不顺，允炆复辟便可能成功。
登基这多日来，每每睡下，朱棣便总是做着同样的恶梦，梦见朱允炆一手托着宝玺，一手持着宝剑，冷冷的笑道：“朱棣，你这篡国的逆贼，你看看这是什么？”
朱棣惊道：“传国玉玺？”
建文帝朱允炆道：“不错，这正是传国玉玺，你手中的十六块宝玺全是假的，你是阴谋篡位的逆贼，全天下的人都容不得你。朱棣，你纳命来罢！”朱允炆手中的宝剑直刺向朱棣的脑袋。
朱棣每每这时惊醒，吓得全身是冷汗。
为免夜长梦多，朱棣密召锦衣卫指挥使纪纲，令他暗中寻查这第十七块宝玺的下落。
纪纲道：“皇上，据微臣派去的密探查知，黄子澄和姚善在南方正在大力募兵，企图对抗朝廷，又闻他二人正准备航海乞兵，臣在想，这第十七块宝玺很有可能就在黄子澄身上。”
朱棣道：“好，你务必将黄子澄这老匹夫活捉回京。一定要得到这第十七块宝玺，要不惜一切代价。”纪纲领命而去。
十多天后，黄子澄便被逮捕入京，然而他身上却并没有传国宝玺，最终黄子澄落得慷慨成仁。
朱棣杀黄子澄而不得宝玺，心中闷闷难安，苦思宝玺下落：“黄子澄身上没有，那又会在谁身上？黄子澄为何要航海乞兵？难道允炆这小子逃到了海外不成，黄子澄是要去与他会合？那么第十七块宝玺便也随他允炆到了海外？当务之急须命人奔赴海外去查找允炆小儿子的踪迹，此事事关机密，又该派谁去好？”思前想后，朱棣决定派亲信贴身太监三保儿完成这个使命。
当晚，朱棣密召三保太监，朱棣道：“保儿，你可知道朕深夜单独召你为何事？”
三保太监跪地磕头道：“奴才愚笨，还请皇上明示。”
朱棣道：“保儿，你自幼随朕左右，这几年来为朕立下不少战功，说心里话，这个世上只有几个人是朕能够信任，放心的，你就是其中的一个。”
三保太监连连磕头：“皇上信得过保儿，保儿为皇上赴汤蹈火，粉身碎骨也在所不辞。”
朱棣道：“严重了，朕怎么舍得你为朕去死。保儿呀，你立下赫赫战功，朕决定赐你一个姓名，以后你便叫郑和吧。”
三保太监又连连磕头谢恩，道：“谢皇上为奴才赐名，从此以后我就叫郑和了，我终于有了自己的姓名了。”
朱棣扶起郑和，道：“郑和，朕有一事要你去办，朕才能放心。”
郑和道：“皇上只管吩咐，郑和一定尽心尽力办到。”
朱棣道：“民间有谣传说建文帝尚在人间，朕虽然是不信，但为了确认此事，朕决定派你去查访，据传闻建文帝极有可能远赴海外。明日朕便亲自为你送行，以通商贸易为名下西洋，实则暗中查寻建文帝的踪迹，倘若建文帝果然如传闻真的在世上，你若有幸找到他，务必将他当场杀之，夺得他身上的第十七块传国宝玺。”
郑和道：“皇上英明，建文帝不死我朝终不得安宁，郑和此番下西洋必不辱圣命。”
第二日，永乐皇帝朱棣亲率文武百官为郑和送行。郑和率兵五千，远航大型船舰十数艘，从此开启了漫长的航行。郑和一生共七次下西洋，与西洋多国通商贸易，让世界知道了东方的大国我大明朝，更使永乐皇帝朱棣的威名远播，他此行打通了与外国的贸易，促进了大明朝经济的快速发展，乃是载入史册的一大壮举，郑和的姓名也永远的载入了史册。
朱棣派郑和下西洋的同时，又命纪纲通令全国，守好严查各处关口，绝不允许放过任何可疑之人。纪纲果真是“尽忠尽职”，秉承着“宁可错杀一千，不可枉纵一人”的精神，在大明各地肆意抓捕杀戮建文朝旧臣，又牵连到许多无辜百姓，闹得是鸡犬不宁，民怨四起。
